在刑事司法实践中，案由（Cause of Action）这一概念至关重要，它是指那些足以使法院对某个行为进行审判的法律规定。然而，在日常工作中，律师和法官往往会面临一系列复杂且令人困惑的问题，这些问题与案由相关联。在本文中，我们将深入探讨这些疑问，并试图找到解决它们的方法。

首先，我们需要明确案由是什么？简单来说，案由就是指那些可以作为起诉或被告辩护依据的法律规定。例如，如果某人因为杀人罪被捕，那么“杀人”这个行为就构成了犯罪行为，而“故意杀人罪”的具体条文则为我们提供了解释该行为是否构成犯罪以及如何定性其严重程度的标准。然而，即便如此，这并不意味着所有情况都能轻易地通过法律条文来解决，因为现实生活中的情境往往比简单的文字描述要复杂得多。

其次，当我们谈到刑事诉讼时，最令人困惑的是关于证据的问题。证据对于确定一个事件是否发生以及它所导致的一系列后果至关重要。但是，在实际操作中，证据可能会变得非常微妙。一方面，我们需要证明嫌疑人的罪行，但另一方面，又不希望无端侵犯他人的权利。这就要求我们在处理证据时既要有足够的谨慎，也要有足够的勇气去追求真相。

再者，对于涉及个人自由权益的情况，更是引发了广泛争议。如果一个人的言论、信仰或者其他基本权利遭受限制，他们通常会寻求法律保护。但是在这样的过程中，他们也必须证明自己的言论或信仰并非煽动暴力或破坏社会秩序。而这正是许多案件中的难点所在：如何平衡公众安全与个人自由？

此外，在现代社会，由于科技发展迅速，一些新型犯罪如网络诈骗、数据泄露等给司法体系带来了新的挑战。这些犯罪手段快速变化，不断出现在各种形式上，使得执法机关和律师团队不得不不断学习新知识，以适应这些新的“作弊技巧”。同时，这也意味着传统意义上的“真相”可能已经不是那么容易得到，因为技术手段可以制造伪造信息，从而改变整个事件的情节。

最后，还有一类特别棘手的是涉及组织性的犯罪，如贩毒集团、黑帮等组织。这类组织内部结构错综复杂，其成员之间关系紧密又神秘，对外界几乎透明度极低。这使得调查人员很难获取直接证据，更别提取证了。此外，这类组织利用恐吓和暴力来维持控制，因此他们背后的支持者和资金来源也是很难揭露出来的问题。

综上所述，虽然我们的目标是探讨刑事诉讼中的最令人困惑的问题，但真正解决这些问题却是一个长期而艰巨的事业。它不仅需要高度专业化的人才，而且还需要持续更新知识库，以适应不断变化的地球环境。在未来的岁月里，无疑还有更多迷雾般厚重的情形等待着我们去揭开，而每一次尝试，都将离真相更进一步一步。