能源消耗过大
空气净化器的工作原理是通过吸入空气后过滤、清除污染物再排放，但这个过程需要消耗一定量的电能。长时间不间断运行会导致能源消耗显著增加，特别是在冬季或夏季时节，室内外温差较大，空调或暖气同时运转时，这种情况更加严重。不仅对家庭和企业的能源账单产生压力，也加剧了全球能源短缺和环境污染的问题。
维护成本升高
随着使用时间的延长，空气净化器内部部件如滤网、风机等可能会出现磨损或积垢。长期不停歇地工作使得这些部件承受更多压力，从而缩短它们的使用寿命。此外，不定期更换过滤网也可能因为未能及时发现问题而忽视，从而导致维护成本的大幅上升。
空气循环不足
虽然空气净化器能够有效去除室内污染物，但如果长时间开启，它们也会阻碍自然风流动，使得室内新鲜空气难以进入。这种现象被称为“负离子效应”，它可能抑制细菌和病毒增长，同时也有助于减少其他有害微生物。但是，如果没有足够的自然通风，这些正离子就会与负离子相互作用，最终导致室内新鲜氧分子的生成受到限制，对人体健康造成影响。
增加灰尘生成
某些型号的空气净化器在运行过程中可能会产生微小颗粒，如静电吸附颗粒（EPA）等，这些颗粒可以携带细菌、病毒甚至是灰尘。在没有适当通风的情况下，这些颗粒容易悬浮在房间里，与正常飞落的小粉尘混合形成复合性粉尘团块，加速了灰尘累积速度，对呼吸系统健康构成隐患。
对敏感群体影响较大
对于一些特殊群体，如儿童、小孩以及心脏病患者，他们对环境因素更为敏感。如果家中安装的是24小时开机状态下的高噪音或者强烈振动类型的空调，可以引起他们额外的心理压力，并且持续的声音干扰睡眠质量，还有振动可能影响到他们的心血管健康。而对于儿童来说，一直处于这样的环境下，其身体还在不断成长发育，每天都要面临这样的刺激，有潜在风险对其神经系统发展造成负面影响。
